专家介绍：
中国科学院上海药物研究所研究员，硕士生导师，J. Chem. Inf. Model.首届青年编委。主要从事分子模拟及药物设计方面的研究工作，专注于分子模拟与药物设计新方法的发展，以及这些方法在药物发现方面的应用研究。
共发表论文100余篇，其中3篇论文的引用超过200次。申请国家发明专利40多项，软件著作权4件。
（1）药物-靶标结合作用的理论研究。率先在药物设计中引入卤键，首次通过计算模拟阐明卤键作用与化合物成药性的关系，阐明了卤键作用的本质，帮助人们进一步理解IUPAC的卤键定义。在卤键方面的研究工作被得克萨斯大学Mahesh Narayan教授评价为教科书式的工作（Molecules 2017, 22 (9)）。发现晶体结构数据中的非键相互作用（卤键、氢键、离子键等）被低估。
（2）药物设计方法发展与软件开发。开发了可以处理卤键的分子对接软件D3DOCKxb，将此软件移植到国产超级计算机上，一天可虚拟筛完4200万个化合物。开发了可以分析口袋动力学性质的软件D3Pockets，可以分析口袋的稳定性、连续性与相关性。开发了基于公共空间的多模态药物-靶标关联预测技术MultiDTI，可以关联新化学实体和新靶标到已知的异构网络。开发了抗新冠肺炎药物靶标预测和虚拟筛选平台D3Targets-2019-nCoV。
（3）应用研究。针对肿瘤及传染性疾病等重要疾病靶标蛋白开展药物设计及结构优化研究，发现了一系列活性化合物。研究了新冠病毒刺突蛋白的动态构象变化，揭示了RBD结构域及全长蛋白与ACE2亲和力差异的分子机制。在原子水平上研究了新冠病毒刺突蛋白上的E484K突变引起免疫逃逸的分子机制，并预测了4个可能产生免疫逃逸的潜在新突变。
徐志建
研究领域：
新材料,石油炼制,石油化工,精细化工,生物医药
研究方向：
药物设计、计算化学、计算生物学
所在单位：
中科院上海药物研究所
