1.基于产业化的药物合成工艺与绿色化学（方法学、生物转化等）研究
2.基于产业化的药物连续流动合成技术与微纳流控化学研究
3.新（农）药与新型功能脂质体辅料开发
4.中药、天然产物与药物杂质的分离纯化与结构确定

1.  黄军海等, PCT/CN2019093380（国际专利）, 叶绿素二氢卟吩类的制备与应用；
2.  黄军海等, CN202010090299.，X二氢卟吩衍生物及其铁螯合物的制备与应用；
3.  黄军海等，CN202010001709.9；一种氨基嘧啶化合物、其制备方法、组合物及应用；
4.  黄军海等，CN201910152396.2，甲氧基取代苯基酰胺类氨基嘧啶衍生物的应用；
5.  黄军海等, CN201910152430.8 ，4-氨基嘧啶取代的苯基酰胺类化合物及其制备
6.  黄军海等, CN 201610063756.X，一种阿扎那韦原料药杂质或其盐、其制备方法和应用；
7.  黄军海等, CN201610236185.5，一种阿扎那韦硫酸盐A型结晶的制备方法；
8.  邵雷，黄军海等，CN201610302564.X，一种制备含有羟基的手性化合物的方法；
9.  黄军海等，CN201611193784.X，一种2,4-二氨基嘧啶衍生物的制备与应用；
10. 黄军海等，CN 201611263830.9，一种多聚间苯三酚类衍生物的制备方法；

承担项目（纵向课题）：
1.国家自然科学基金面上项目，仙鹤草酚B抗癌先导优化与有机金属基的协同增效研究，31570360, 75.6万，2016.01-2020.12, 主持
2.上海市优秀学术技术带头人项目，针对FOXP3蛋白翻译后修饰的PIM1抑制剂的设计与合成，17XD1423000，40.0万，2017.05-2020.04，主持
3.上海市科委青年科技启明星项目，抗艾滋药物阿扎那韦环氧中间体创新制备工艺研究，14QB1404800，40.0万，2014.06-2016.06，主持
4.上海市科委产学研医项目，耐药性艾滋病病毒治疗药物的研究与开发， 14DZ1930200，400.0万，2014.09-2017.09，主持
5.国家自然科学基金青年基金，OfHex1抑制剂的合成与设计，31702070，31.2万，2018.01-2020.12，参与（团队负责人）
6.上海市科委青年科技启明星项目，肿瘤乏氧检测与乏氧前药的设计、合成与性能研究，18QB1404000，  40.0万，2018.05-2021.04，参与（团队负责人）
7.上海市自然科学基金项目，靶向于VEGFR的新型先导化合物的设计合成与活性研究，17ZR1429300，20.0万，2017.05-2020.04，参与（团队负责人）
8.上海市科委青年科技启明星项目，新型微管蛋白抑制剂的合成工艺改进及结构优化，16QB1403800，     40.0万，2016.05-2019.04，参与（团队负责人）
承担项目（横向课题）：
1.药用树脂合成关键催化剂配体G的合成，260万，主持；
2.奥希替尼工艺与乏氧新药开发，150万，主持；
3.催化剂PJG-06 的研究与开发，120万，主持；
4.药用天然产物简单衍生物合成与结构确证研究，50万，主持；
5.有机硅或聚醚改性的功能色素的定制合成，200万，主持；
6.植物生产调节剂的研究与开发，40.0万，主持；
7.盐酸考来维仑的研制与开发，FZYA-201304，300万，主持；
8.阿扎那韦的研制与开发，FZYA-201305，300万，主持；
9.泊沙康唑的研制与开发，FZYA-201302，400万，主持；
10.卢比前列酮研制与开发，FZYA-201303，400万，主持；
11.依曲韦林中试工艺，SIPI-ZJZX-06，200万，主持；

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