生物医药

人工基因组设计与合成、DNA智能制造技术

Synthetic Biology;Saccharomyces Cerevisiae;Gene Editing;3d Genome Organization;Mating-type Switching;Polyploidy;Ring Chromosome;Crispr/cas9;Synthetic Yeast Chromosomes;Synthetic Yeast Genome Project (sc2.0)

Ji-Ren Wen, Hong-Yu Xie, Ze-Xiong Xie*, Ying-Jin Yuan. Exogenous and endogenous optimization for efficient nonconical amino acids incorporation in Saccharomyces cerevisiae. Chemical Engineering Journal, 2025, 508:160952.
Yan Zheng, Xi-Chen Cui, Fei Guo, Ming-Liang Dou, Ze-Xiong Xie*, Ying-Jin Yuan*. Design and structure of overlapping regions in PCA via deep learning. Synthetic and Systems Biotechnology, 2025, 10(2):442-451.
Ze-Xiong Xie#, Jianting-Zhou#, Juan Fu#, Ying-Jin Yuan*. Debugging: putting the synthetic yeast chromosome to work. Chemical Science, 2021, 12(15): 5381-5389.
Juan Wang#, Ze-Xiong Xie#, … Ying-Jin Yuan. Jin*. Ring synthetic chromosome V SCRaMbLE, Nature Communications, 2018, 9(1):3783.
Ze-Xiong Xie#, Bing-Zhi Li#, … Ying-Jin Yuan*. "Perfect" designer chromosome V and behavior of a ring derivative. Science, 2017, 355 (6329):eaaf4704.

一种DNA序列的拆分方法及装置，元英进、谢泽雄、郑妍、郭菲，ZL202310487247.X。
一种DNA串联重复单元的拆分组装方法，元英进、谢泽雄、殷振宁、赵昊乾、高峰，ZL202111612169.9。
一种DNA片段合成难度预测的方法及装置，元英进、郑妍、谢泽雄、郭菲，ZL202211330209.5。
一种DNA串联重复序列的合成方法，元英进、谢泽雄、赵昊乾、殷振宁、许王月、高峰，ZL202111615173.0。
一种基因在调控菌株对抑制剂耐受性中的应用，元英进、谢泽雄、陈涛、李霞，ZL202110718066.4。

国家重点研发计划“合成生物学”重点专项，迷你染色体的设计构建与应用，2022-2027，负责人；
国家自然科学基金面上项目，聚合酶链式组装法构建双链DNA片段的关键调控序列特征解析与智能拆分研究，2024-2027，负责人；
天津市物质绿色创造与制造海河实验室产业支撑项目，人工染色体构建关键技术创新与应用，2025-2027，参与；
国家重点研发计划“颠覆性技术”重点专项，DNA片段智能制造关键技术研究，2020-2021，负责人；
国家重点研发计划“合成生物学”重点专项，精准合成修饰蛋白质的酵母底盘细胞的设计与构建，2019-2024，参与；
国家自然科学基金青年基金，复合抑制剂耐受酵母的环形染色体基因拷贝数变异热点检测研究，2020-2022，负责人；
天津市自然科学基金，合成型酿酒酵母环形染色体诱导重排与功能重塑研究，2020-2022，负责人。

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